金融学院成立于2012年10月，其前身为南京农业大学经济管理学院的会计与金融系。南京农业大学金融学和会计学的教学研究历史悠久，早在20世纪初期卜凯教授就开始从事农业保险的调查研究工作。1985年，南京农业大学开始招收农村金融专业的本科生，是江苏省最早招收金融方面本科生的高等院校。20世纪80年代开始招收农村金融方向和会计审计方向硕士研究生，1998年取得金融学专业硕士学位授予权，2004年取得会计学专业硕士学位授予权，2002年开始招收农村金融专业博士生，2010年在应用经济学一级学科下设金融学专业博士点。
金融学院目前拥有金融学专业博士、金融学硕士、会计学硕士、金融专硕、会计专硕、MBA等多层次的研究生培养体系，曾经专门为中国农业银行总行、中国人民银行南京分行等举办金融学硕士班，为政府有关部门、银行、保险公司、证券公司、会计审计事务所等培养了众多高层次的金融、会计和审计方面的专业人才。
金融学院现有金融学和会计学两个本科专业，其中金融学专业是江苏省品牌专业，会计学专业是江苏省特色专业，2012年金融学专业和会计学专业又成为江苏省重点建设专业。
金融学院现有专职教师及研究人员总计20多人，其中教授8人，副教授8人，80%以上拥有博士学位，具有较高的教学水平和研究能力。
金融学院教师依托江苏省高校哲学社会科学重点研究基地——江苏省农村金融发展研究中心、南京农业大学中国金融和区域经济研究中心、南京农业大学财政金融研究所等研究平台开展研究工作。近几年来，本院教师主持国家社科基金重大项目、国家自然科学基金、国家社科基金、教育部、农业部、世界银行等各种省部级以上课题80多项，在《管理世界》、《金融研究》、《经济学季刊》、《中国农村经济》等核心刊物上发表研究论文200余篇，获得省部级等各种奖励20多项。
金融学
A培养目标：本专业培养具备金融学方面的理论知识和业务技能，能在银行、证券、投资、保险及其他经济管理部门和企业从事相关工作的专门人才。
B培养对象：本科，四年，授予经济学学士学位。
C主要课程：微观经济学、宏观经济学、公共经济学、货币银行学、国际金融、投资学、保险学原理、商业银行管理学、中央银行学、公司金融、风险投资、金融工程学、期货交易基础、计量经济学等。
D就业情况：就业率100%，去向主要是在银行、证券、投资、保险及其它经济管理部门和企事业单位工作。
会计学
A培养目标：本专业培养具备管理、经济、法律和会计等方面的知识和能力，能在企、事业单位及政府部门从事会计实务以及教学、科研方面工作的应用型、复合型专门人才。
B培养对象：本科，四年，授予管理学学士学位。
C主要课程：管理学、微观经济学、宏观经济学、管理信息系统、统计学、基础会计学、财务管理、市场营销、经济法、财务会计、成本会计、管理会计、审计学等。
D就业情况：就业率98.5%，主要到企、事业单位及政府部门从事会计实务以及教学、科研方面工作。
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